硕士论文检测系统检测结果出现异议时，作者可通过系统申请异议，提交相关证据进行审核。系统会对异议进行严格审查，包括查重等环节。经过审核后，系统会给出处理结果，若异议成立，则会对检测结果进行调整。

硕士论文检测系统检测结果异议处理流程一般包括提交异议申请、系统审核、处理结果通知等步骤。作者需提供充分的证据支持异议，并配合系统的审核工作。处理结果可能会影响论文的最终检测结果，因此建议作者在申请异议时务必详细说明情况。